複製品的我也會談戀愛。

替換身體不適的素直前往學校上課的複製品小直。在文藝部與青梅竹馬律子共度時光時，一名非入部時節的入部申請者出現了。他就是曾為籃球部王牌的同班同學真田秋也。

小直宣佈上學時會將頭髮紮成公主頭作為標記，好讓真田在教室裡更容易找她說話。原本期待的遠足是由素直參加，許久未上學的小直看著同學們熱烈討論回憶，心中感到十分羨慕。就在此時，真田主動上前找她說話……

暑假結束後，真田一直很在意小直有一段時間沒來學校。聽到律子說「小直學姐不是每天都會來的喔」時，他猛然驚覺。一個月後，真田對終於來學校的小直問道：「妳，難道不是愛川素直嗎？」

為了實現秋也的復仇，小亞決定與前籃球社的早瀨學長進行籃球對決。小直與廣中律子一同在一旁守護著那英姿。而在進行現場轉播的智慧型手機視訊通話另一頭，愛川素直與真田秋也也在看著——

茫然站在車站的秋也，透過電話告訴素直，小直可能已經去世了。素直感到震驚與動搖。在鐵軌下方，發現了小直穿過的制服、鞋子，以及淺藍色髮圈——

前學生會的森涼未與前學生會副會長望月隼出現在社團教室，小直等人得知了文藝部面臨廢部危機的消息。在為了阻止廢部而努力準備文化祭活動的過程中，校內散發著暗示分身存在的傳單。

與秋也去水族館約會後的隔天。小直受到同學佐藤的邀請「要不要一起吃便當？」，迎來了第一次在女生群體中吃午餐。之後，小直與佐藤前往圖書室時，遇見了臉色沉重地走著的律子——

青陵祭的第二天，是小直代替素直去上學的日子。無論是穿上女僕裝，還是和秋也一起體驗鬼屋，小直都在心跳加速中享受著人生第一次的文化祭。接著，就在終於要迎來舞台發表正式開始前，小直得知了涼未深藏的過去。

帷幕拉開，由律子撰寫劇本的「新譯竹取物語」舞台劇正式開演。雖然一切都按照練習順利進行，但在後半段即將進入輝夜姬與老嫗們告別的場景時，小直察覺到了涼未對這個故事的想法，並朝著涼未拋出了劇本中沒有的、發自內心的提問。

在涼未過世、同時對小亮消失的悲傷與衝擊仍未消逝之中，小直被素直告知今後將由她自己去上學。在感到困惑而窩在家中的小直身邊，律子和亞紀突然前來說「一起去溫泉吧」——

修學旅行的目的地京都，以及涼的故鄉富士宮——素直和小直各自朝著不同的目的地出發。素直與秋也、佐藤、吉井一同遊覽觀光名勝的過程中，逐漸與他們打成一片。另一方面，抵達富士宮的小直和亞希，在牧場享受體驗活動時，偶然遇見了某位「前輩」。

在享受修學旅行的過程中，素直被不怎麼熟的同學單方面告白。正當她因為對方所說的話感到心情低落時，佐藤走了過來。面對言詞率直的佐藤，素直向他傾訴了深藏在心中的所有心意。另一方面，盡情享受富士宮之旅的小直，則向望月和亞希提議舉辦修學旅行必備的「枕頭大戰」，氣氛熱烈——

幫忙採收馬鈴薯、前去觀賞美麗的富士山……小直感受著更迭季節之美，也漸漸察覺自己內心發生的變化。就在這時，受到素直和秋也召喚的小直與亞希，將後續的事託付給望月後，動身前往京都會合。就這樣，身為本體與複製品的四個人在京都聚集了，但狀況似乎有些不對勁——