半坪漫咖宿生活！

秋田的高中生森田芽衣子被選為條件優渥得過頭的天宮女學院轉學生，開始了在東京的宿舍生活。宿舍同時也是漫畫咖啡店，她必須作為服務活動在店裡工作。店主兼宿舍長的大小姐天宮梨繪、影片創作者鈴木萬里花、專業玩家中埜音緒。與這些室友們在單邊榻榻米大小的漫咖生活就此展開！但芽衣子之所以能轉學，是因為被誤認為是新人漫畫家「森田芽衣子」……。

芽衣子逐漸習慣了在漫畫喫茶的生活，會和音緒一起去採購，也會和大家一起構思店裡的新菜單。就在某一天，梨繪的母親，同時也是天宮女學院理事長的天宮梢來到店裡造訪。接著，梢宣告了如果再這樣下去店鋪就要倒閉。沒想到店裡因為梨繪的放漫經營，被發現陷入了巨額赤字。芽衣子等人趕忙著手改善經營狀況，然而……！？

芽衣子與音緒一起玩殭屍遊戲、與萬里花拍攝要上傳的影片，和大家一起度過快樂的每一天。某天，在同棟大樓的貓咪咖啡廳工作的愛貓少女成海美智香闖進了店裡。美智香正為了梨繪強行擴張店面，導致貓咪咖啡廳變窄一事而生氣……。漫畫店與貓咪咖啡廳，這場跨業種的對決即將展開……！？

正值盛夏，漫畫店生意興隆，讓芽衣子等人心情大好。然而冷氣卻突然故障，不得不被迫暫時停業。經營好不容易步上軌道卻遇上此事，面對感到失望的梨繪，梢在一旁給予鼓勵。隨後，對於在冷氣修好前不知該去何處生活的芽衣子等人，梢提議前往關島的別墅。芽衣子她們也帶著美智香，突然地向南國度假勝地出發了！

回想起先前的關島旅行，芽衣子顯得有些鬆懈。然而期末考卻滿江紅，確定要補考。與同樣要補考的夥伴萬里花、音緒一起，在成績優異的梨繪指導下，甚至連美智香也被捲入，展開了瘋狂苦讀。接著迎來了暑假，萬里花與音緒回老家省親。好不容易熬過補課的芽衣子，雖然也打算回到水織等弟妹們等待著的家中，但她卻很在意獨自留在店裡的梨繪……。

暑假快結束了。雖然發生過芽衣子弄丟內褲，結果沒穿內褲在店內晃來晃去的小插曲，但回老家省親的音緒與萬里花也回來了，店裡完全恢復往常的氣息。此時眾人注意到有一位一直住在店裡的客人，芽衣子等人便前往進行身分確認。那位客人看著歷史漫畫感到興奮，說話語氣像武士，是個想掩蓋來歷的可疑女性……究竟她的真實身分是！？

即使第二學期開始，芽衣子等人依然過著一如往常的日子。 美智香和玲也完全成了店裡的常客。在高中聊輕小說、換座位，或是在社團教室玩遊戲、因為尺度較大的同人誌而情緒高漲。 生活徹底墮落的萬里花，在影片直播中因為腰痛而露出了內褲。 大家一起幫忙改善體質。音緒則是為了遊戲大會而展開猛特訓。 大家的漫咖生活依然持續著……！

季節是秋天。天宮女學院的大運動會開始了。 芽衣子本想悠閒地享受其中，但大小姐學校的規模完全不同。 在代理理事長梨繪的主導下，各種撒著鈔票、擺滿高額道具、砸下重金的競賽接連登場。 體育服是貼身短褲。而冠軍獎品是一整頭和牛。 為了讓老家的弟妹們能吃到和牛，芽衣子決定以奪冠為目標……！

正在整理店裡倉庫的芽衣子等人發現了拍貼機，決定大家一起來拍張照。萬里花發現了被自己封印起來的黑歷史物品，企圖偷偷處理掉。這時，某個神祕人物正悄悄逼近她……。芽衣子、梨繪、音緒、美智香和小鈴發揮各自的特長，合力追查被綁架的萬里花的下落。究竟犯人的真實身分是誰，其目的又是什麼……！？

芽衣子等人一起在店裡度過了聖誕節，並對這段緣分感到喜悅。接著到了年末，芽衣子決定帶著梨繪一起回老家。梨繪至今仍以為芽衣子是漫畫家「森田芽衣子」，並說想去參觀芽衣子的老家。芽衣子想起誤會還沒解開，感到無比焦慮。總之，為了隱瞞到底，她試圖干擾梨繪與水織的對話，然而……！？

芽衣子的秘密終於曝光，漫畫家「森田芽衣子」的真實身分也隨之揭曉。貝爾娜的報告書將一切查得清清楚楚。誤會終於冰釋，梨繪她們非但沒有生氣，反而很乾脆地接受了。然而，芽衣子卻因為沒能親口說出真相而懷著愧疚感，內心痛苦不已。芽衣子心想「難道這樣真的好嗎？」，並下定決心要好好面對梨繪……。